Analyse av enkeltcelle kopitallsvariasjon
Analyse av enkeltcelle kopitallsvariasjon (scCNV) detekterer gevinster og tap av genomiske segmenter innenfor individuelle celler, noe som gjør det mulig for forskere å løse intratumorheterogenitet, rekonstruere klonal evolusjon og skille maligne fra normale celler med enkeltcelleoppløsning. Det kan anvendes direkte på enkeltcelle helgenomsekvenseringsdata eller utledes fra lesedybdesignaler i scRNA-seq eller scATAC-seq eksperimenter.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Metodekart
Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.
Kilder
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Hvilken metode?
Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.
- Analyse av kopiantallsvariasjonBioinformatikk↔ sammenlign
- Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)Bioinformatikk↔ sammenlign
- Enkeltcelle-GWASBioinformatikk↔ sammenlign
- Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Bioinformatikk↔ sammenlign
- Analyse av differensial genuttrykk i enkeltcelle-RNA-sekvenseringBioinformatikk↔ sammenlign
- Variant CallingBioinformatikk↔ sammenlign
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →