Nettverksbasert GWAS — Nettverksbasert genomdekkende assosiasjonsstudie
Nettverksbasert GWAS integrerer resultater fra konvensjonelle genomdekkende assosiasjonsstudier med biologiske nettverksdata – som protein-protein-interaksjonsnettverk (PPI) eller gen-koekspresjonsgrafer – for å identifisere sykdomsrelevante genmoduler eller subnettverk. I stedet for å rapportere kun de mest signifikante individuelle SNP-ene, sprer denne tilnærmingen assosiasjonssignaler gjennom molekylære interaksjonsnettverk, og avdekker genklynger hvis kollektive signal impliserer dem i kompleks-egenskapsbiologi, selv når ingen enkeltvariant alene når genomdekkende signifikans.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analyse av kopiantallsvariasjonBioinformatikk↔ compare
- eQTL-analyseBioinformatikk↔ compare
- Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Bioinformatikk↔ compare
- Genom-omfattende assosiasjonsstudie (GWAS)Bioinformatikk↔ compare
- Nettverksbasert eQTL-analyseBioinformatikk↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatikk↔ compare
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →