Nettverksbasert analyse av enkeltcelle-RNA-seq
Nettverksbasert analyse av enkeltcelle-RNA-seq utvider standard arbeidsflyter for scRNA-seq ved å konstruere og undersøke molekylære interaksjonsnettverk — genreguleringsnettverk, koekspresjonsnettverk eller celle-celle-kommunikasjonsgrafer — fra enkeltcelle-transkriptomiske data. I stedet for å behandle hvert gen uavhengig, fanger denne tilnærmingen den koordinerte aktiviteten til genkretser og intercellulære signalveier innenfor og mellom populasjoner av celler, noe som muliggjør en systemnivåvisning av transkripsjonell regulering med enkeltcelleoppløsning.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Bioinformatikk↔ compare
- Nettverksbasert RNA-seq analyse av differensiell ekspresjonBioinformatikk↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatikk↔ compare
- RNA-seq differensialuttrykkBioinformatikk↔ compare
- Single-cell eQTL-analyseBioinformatikk↔ compare
- Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Bioinformatikk↔ compare
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →