Process / pipelineBioinformatics / omics

Pathway Enrichment Analysis — Biologisk Pathway Enrichment Analysis

Pathway enrichment analysis (PEA) er en statistisk tilnærming som tar en liste over gener eller proteiner av interesse — typisk utledet fra et eksperiment med differensiell ekspresjon eller proteomikk — og identifiserer hvilke forhåndsdefinerte biologiske veier eller funksjonelle gen-sett som er representert oftere enn forventet ved tilfeldighet. Ved å kartlegge individuelle molekylære endringer til kuraterte kunnskapsbaser for veier som KEGG, Gene Ontology eller Reactome, oversetter PEA lange genlister til tolkbare biologiske prosesser, noe som gjør det til et sentralt verktøy i etteranalysen av høyt gjennomstrømmende omics-eksperimenter.

Åpne i MethodMindSnartVideoSnartLast ned lysbilder

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Metodekart

Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.

Pathway Enrichment Analysis

Genesettanrikelsesanalys…Metabolomanalyse Nettverksbasert berikels…Proteomikk-analyse RNA-seq differensialuttr…Analyse av enkeltcelle-R…Bayesiansk ChIP-seq topp…Bayesiansk eQTL-analyse Bayesian genesettberikel…Bayesiansk GWAS

+43 til

Kilder

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Hvilken metode?

Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.

Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Bioinformatikk↔ sammenlign
MetabolomanalyseBioinformatikk↔ sammenlign
Nettverksbasert berikelsesanalyse av signalveierBioinformatikk↔ sammenlign
Proteomikk-analyseBioinformatikk↔ sammenlign
RNA-seq differensialuttrykkBioinformatikk↔ sammenlign
Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Bioinformatikk↔ sammenlign

Sammenlign side om side →

Referert av

Bayesiansk ChIP-seq toppkalling Bayesiansk eQTL-analyse Bayesian genesettberikelsesanalyse Bayesiansk GWAS Bayesiansk metabolomikk-analyse Bayesiansk Pathwayberikelsesanalyse Bayesiansk proteomikk-analyse Bayesiansk RNA-sekvensering differensiell ekspresjon Differensiell Epigenom-Vid Assosiasjonsstudie Differensiell eQTL-analyse Differensiell metabolomikkanalyse Differensiell banearbeidsanalyse Differensiell proteomikk-analyse Epigenom-vid assosiasjonsstudie (EWAS)eQTL-analyse Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Genom-omfattende assosiasjonsstudie (GWAS)Maskinlæringsassistert eQTL-analyse Maskinlæringsassistert gen-sett-anrikningsanalyse Maskinlæringsassistert analyse av mikrobiomdiversitet Maskinlæringsassistert RNA-seq differensialuttrykksanalyse Maskinlæringsassistert analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering Metabolomanalyse Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Multi-omics gen-settberikningsanalyse Multi-omics metabolomics analysis Multi-omikk mikrobiomdiversitetsanalyse Multi-omikk-proteomikkanalyse Analyse av multiomikk-data fra enkeltceller Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner Nettverksbasert Epigenom-vid Assosiasjonsstudie (Network EWAS)Nettverksbasert eQTL-analyse Nettverksbasert gen-sett berikelsesanalyse Nettverksbasert GWAS Nettverksbasert metabolomikkanalyse Nettverksbasert analyse av mikrobiomdiversitet Nettverksbasert RNA-seq analyse av differensiell ekspresjon Nettverksbasert analyse av enkeltcelle-RNA-seq Proteomikk-analyse RNA-seq differensialuttrykk Single-cell eQTL-analyse Enkeltcelle-genberikelsesanalyse Enkeltcelle-GWAS Analyse av enkeltcellemetabolomikk Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Analyse av differensial genuttrykk i enkeltcelle-RNA-sekvensering Tidsrekke-genmengdeberikelsesanalyse – Dynamisk vei-berikelse over tidspunkter Tidsrekkeanalyser i metabolomikk Tidsrekkeanalyse av mikrobiomdiversitet Tidsrekke-anrikningsanalyse av signalveier Tidsrekke RNA-seq Differensiell Ekspresjon Tidsrekkeanalyse av enkeltcelle-RNA-seq

Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →