Hi-C-analyse
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) er en teknikk og tilhørende beregningsmetoder for å kartlegge den 3D-arkitekturen til genomet i celler. Utviklet av Lieberman-Aiden og Dekker i 2009, identifiserer Hi-C fysiske interaksjoner mellom genomiske regioner som kan være fjerntliggende i lineær sekvens, men romlig proksimale i 3D nukleært rom. Hi-C-analyse har avslørt grunnleggende prinsipper for genomorganisering, inkludert eksistensen av topologisk assosierende domener (TADs), og gir innsikt i hvordan 3D-struktur regulerer genuttrykk og DNA-replikasjon.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/no/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq-analyseGenetikk↔ compare
- RNA VelocityGenetikk↔ compare
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →