Analyse av mangfold i enkeltcelle-mikrobiom
Analyse av mangfold i enkeltcelle-mikrobiom løser sammensetningen og funksjonell heterogenitet av mikrobielle samfunn på nivået av individuelle celler eller bakterier. Ved å kombinere isolering av enkeltceller eller enkeltbakterier med høyt gjennomstrømningssekvensering, overvinner denne pipelinen gjennomsnittseffekten av bulk-metagenomikk, noe som muliggjør deteksjon av sjeldne stammer, variasjon innen arter og celle-til-celle-heterogenitet innen komplekse mikrobiomer som tarmen, munnhulen eller miljøprøver.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Metodekart
Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.
Kilder
- Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. link ↗
- Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis
Hvilken metode?
Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.
- Multi-omikk mikrobiomdiversitetsanalyseBioinformatikk↔ sammenlign
- Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Bioinformatikk↔ sammenlign
- Enkeltcelle-variantkallingBioinformatikk↔ sammenlign
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →