Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner
Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner (CNV) integrerer genomdekkende CNV-data med biologiske interaksjonsnettverk – som protein-protein-interaksjon (PPI) eller signalveinettverk – for å identifisere funksjonelt koherente regioner, drivergener og endrede subnettverk som rå CNV-kalling alene ville oversett. Ved å forplante CNV-signaler gjennom nettverksgrafen avslører metoden koordinerte genomiske doseubalanser som konvergerer mot felles biologiske funksjoner, noe som gjør den spesielt kraftig innen kreftgenomikk og studier av sjeldne sykdommer.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analyse av kopiantallsvariasjonBioinformatikk↔ compare
- Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Bioinformatikk↔ compare
- Nettverksbasert GWASBioinformatikk↔ compare
- Nettverksbasert RNA-seq analyse av differensiell ekspresjonBioinformatikk↔ compare
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatikk↔ compare
- Variant CallingBioinformatikk↔ compare
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →