ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner

Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner (CNV) integrerer genomdekkende CNV-data med biologiske interaksjonsnettverk – som protein-protein-interaksjon (PPI) eller signalveinettverk – for å identifisere funksjonelt koherente regioner, drivergener og endrede subnettverk som rå CNV-kalling alene ville oversett. Ved å forplante CNV-signaler gjennom nettverksgrafen avslører metoden koordinerte genomiske doseubalanser som konvergerer mot felles biologiske funksjoner, noe som gjør den spesielt kraftig innen kreftgenomikk og studier av sjeldne sykdommer.

Åpne i MethodMindSnartVideoSnartDownload slides

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Kilder

  1. Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111
  2. Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateNetwork-based copy number variation analysis (Network-Based Copy Number Variation Analysis). Hentet 2026-06-15 fra https://scholargate.app/no/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis · Datasett: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026