Process / pipelineBioinformatics / omics

Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)

Genesettanrikelsesanalyse (GSEA) er en beregningsmetode som bestemmer om et forhåndsdefinert sett med gener – som representerer en biologisk bane, prosess eller funksjon – viser statistisk signifikante, koordinerte forskjeller mellom to biologiske tilstander. I motsetning til enkel fold-endringsfiltrering, opererer GSEA på alle målte gener rangert etter en korrelasjonsmetrikk, og oppdager subtile, men konsistente skift over en hel bane, selv når ingen enkelt gen passerer en signifikansgrense.

Åpne i MethodMindSnartApply, compare, get guidance

Tools & resources

Last ned lysbilder

Learn & explore

VideoSnart

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Metodekart

Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.

Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)

Multi-omics gen-settberi…Nettverksbasert gen-sett…Pathway Enrichment Analy…RNA-seq differensialuttr…Analyse av enkeltcelle-R…Bayesian genesettberikel…Bayesiansk mikrobiomdive…Bayesiansk Pathwayberike…Bayesiansk RNA-sekvenser…Differensiell ChIP-seq P…

+27 til

Kilder

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Hvilken metode?

Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.

Multi-omics gen-settberikningsanalyseBioinformatikk↔ sammenlign
Nettverksbasert gen-sett berikelsesanalyseBioinformatikk↔ sammenlign
Pathway Enrichment AnalysisBioinformatikk↔ sammenlign
RNA-seq differensialuttrykkBioinformatikk↔ sammenlign
Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Bioinformatikk↔ sammenlign

Sammenlign side om side →

Referert av

Bayesian genesettberikelsesanalyse Bayesiansk mikrobiomdiversitetsanalyse Bayesiansk Pathwayberikelsesanalyse Bayesiansk RNA-sekvensering differensiell ekspresjon Differensiell ChIP-seq Peak Calling Differensiell banearbeidsanalyse eQTL-analyse Maskinlæringsassistert gen-sett-anrikningsanalyse Maskinlæringsassistert berikelsesanalyse av signalveier Maskinlæringsassistert RNA-seq differensialuttrykksanalyse Maskinlæringsassistert analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering Metabolomanalyse Multi-omics gen-settberikningsanalyse Multi-omics metabolomics analysis Multi-omikk mikrobiomdiversitetsanalyse Multi-omikk-anrikning av biologiske veier Multi-omikk-proteomikkanalyse Multi-omikk RNA-seq differensiell uttrykksanalyse Analyse av multiomikk-data fra enkeltceller Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner Nettverksbasert gen-sett berikelsesanalyse Nettverksbasert GWAS Nettverksbasert metabolomikkanalyse Nettverksbasert analyse av mikrobiomdiversitet Nettverksbasert berikelsesanalyse av signalveier Nettverksbasert RNA-seq analyse av differensiell ekspresjon Nettverksbasert analyse av enkeltcelle-RNA-seq Pathway Enrichment Analysis Proteomikk-analyse RNA-seq differensialuttrykk Enkeltcelle-genberikelsesanalyse Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Analyse av differensial genuttrykk i enkeltcelle-RNA-sekvensering Tidsrekke-genmengdeberikelsesanalyse – Dynamisk vei-berikelse over tidspunkter Tidsrekke-anrikningsanalyse av signalveier Tidsrekke RNA-seq Differensiell Ekspresjon Tidsrekkeanalyse av enkeltcelle-RNA-seq

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →