Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)
En enkeltcelle epigenom-vid assosiasjonsstudie (scEWAS) undersøker epigenetiske merker – primært DNA-metylering eller kromatin-tilgjengelighet – på tvers av hele genomet med enkeltcelleoppløsning, og assosierer deretter variasjon i disse merkene statistisk med en fenotype, sykdom eller eksponering. Ved å løse opp celle-type-heterogenitet som bulk EWAS ikke kan separere, identifiserer scEWAS epigenetiske signaler som er spesifikke for sjeldne eller blandede cellepopulasjoner, snarere enn gjennomsnittlig på tvers av vev.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Metodekart
Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.
Kilder
- Zhang, Y., et al. (2022). Single-cell epigenome analysis reveals age-associated decay of heterochromatin domains in excitatory neurons in the mouse brain. Cell Research, 32(1), 1-18. link ↗
- Aryee, M. J., et al. (2014). Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays. Bioinformatics, 30(10), 1363-1369. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu049 ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study
Hvilken metode?
Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.
- Epigenom-vid assosiasjonsstudie (EWAS)Bioinformatikk↔ sammenlign
Referert av
Similar methods
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →