Yapay Zekâ

112 — metody v této rodině.

Vybrané

Analýza příměsíAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, Stephe Rekonstrukce ancestrálních stavůAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns of Analýza ATAC-seqATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and c ChIP-seq Peak CallingChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based Teorie koalescenceCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John Kingma Analýza variací počtu kopiíCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

Cesta četby

Nejčastěji odkazované základní metody tohoto tématu v pořadí, v jakém vznikaly — místo, kde začít, pokud jste tu nově.

Analýza variací počtu kopií1998–2006od Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
Analýza obohacení drah2003–2005od Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
Analýza obohacení genových sad (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)od Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
Genomová asociační studie (GWAS)2005–2007od Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
Celogenomová asociační studie epigenomu (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)od Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
Analýza diferenciální exprese RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)od Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
Analýza jednobuněčné RNA-seq2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016od Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
Volání variant2009–2010 (modern high-throughput era)od Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)

všechny metody na této polici ↓

Všechny metody 112

Analýza příměsí Rekonstrukce ancestrálních stavů Analýza ATAC-seq ChIP-seq Peak Calling Teorie koalescence Analýza variací počtu kopií Analýza CRISPR screeningů Rekonstrukce pomocí kryo-EM De novo sestavení transkriptomu Volání diferenciačních vrcholů v ChIP-seq Diferenciální analýza variací počtu kopií Diferenciální epigenom-široká asociační studie Diferenciální eQTL analýza Analýza diferenciální metabolomiky Diferenciální analýza obohacení drah Diferenciální proteomická analýza Diferenciální analýza jednobuněčné RNA-seq Diferenciální volání variant Celogenomová asociační studie epigenomu (EWAS)Epigenom-široká asociační studie ve výzkumu vzdělávání eQTL Analýza Statistika F (FST)GCTA Analýza obohacení genových sad (GSEA)Genomová asociační studie (GWAS)Genomická asociační studie ve výzkumu vzdělávání Analýza Hi-C Test HKA Vyhledávání profilů HMMER Homologní modelování Mapování IBD Analýza LD bloků Volání vrcholů ChIP-seq s asistencí strojového učení Analýza variací počtu kopií (CNV) s asistencí strojového učení Epigenom-široká asociační studie s podporou ML (ML-EWAS)Analýza eQTL s podporou strojového učení Analýza obohacení genových sad asistovaná strojovým učením GWAS s podporou strojového učení Analýza metabolomiky s asistencí strojového učení Analýza diverzity mikrobiomu s asistencí strojového učení Analýza obohacení drah asistovaná strojovým učením Fylogenetická analýza s asistencí strojového učení Analýza diferenciální genové exprese RNA-seq s asistencí strojového učení Strojové učení asistovaná sekvenční aligmentace Analýza jednobuněčné RNA sekvenace (scRNA-seq) s asistencí strojového učení Volání variant asistované strojovým učením McDonald-Kreitmanův test Analýza metabolomiky Metagenomické třídění Molekulární dokování Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Víceomická analýza eQTL Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Analýza multi-omických metabolomických dat Víceomická analýza diverzity mikrobiomu Vícevrstvá analýza obohacení drah Multi-omics Phylogenetic Analysis Multi-omická proteomická analýza Analýza diferenciální exprese multi-omických dat RNA-seq Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Síťová analýza změn počtu kopií genů Síťově orientovaná epigenomově-asociační studie (Network EWAS)Síťová analýza eQTL Síťově orientovaná celogenomová asociační studie (Network-based GWAS)Analýza metabolomiky založená na sítích Analýza diverzity mikrobiomu založená na sítích Síťová analýza obohacení drah Síťová fylogenetická analýza Síťově orientovaná analýza diferenciální exprese RNA-seq Síťová analýza jednobuněčné RNA-seq Volání variant založené na síti Analýza obohacení drah Farmakoforní modelování Fylogenetická analýza Fylogenetické nezávislé kontrasty Polygenní rizikový skór (PRS)Topologie PPI sítí Proteomická analýza QSAR Mapování QTL RNA Velocity Analýza diferenciální exprese RNA-seq Selection Sweep (Tajima's D)Zarovnání sekvencí Volání vrcholů v ChIP-sekvenování jednotlivých buněk Analýza variací počtu kopií jediné buňky Jednobuňková epigenomová asociační studie (scEWAS)Analýza eQTL jednotlivých buněk Jednorozměrná analýza obohacení genových sad Jednotlivá-buněčná GWAS Analýza metabolomiky jednotlivých buněk Analýza diverzity jednobuněčných mikrobiomů Analýza fylogeneze jednotlivých buněk Analýza jednobuněčné RNA-seq Analýza diferenciální exprese genů v jednobuněčné RNA sekvenaci Single-cell Sequence Alignment Detekce variant v jednotlivých buňkách Volání píků z časových řad ChIP-seq – profilování temporálního chromatinu Analýza časových řad variací počtu kopií Časově-řádková celoepigenomová asociační studie – longitudinální EWAS Analýza eQTL v časových řadách Časově-řádková analýza obohacení genových sad Analýza časových řad metabolomiky Analýza diverzity mikrobiomu v časových řadách Analýza obohacení časových řad pro dráhy Časově-řádová fylogenetická analýza Analýza proteomiky časových řad Diferenciální exprese časových řad RNA-seq Analýza jednobuněčné RNA-seq v časových řadách Volání variant v časových řadách Test přenosu nerovnováhy Volání variant

Více ve skupině Vědy o životě

İstatistik 21 Karar Bilimleri 7 Ölçme & Psikometri 122 Nedensellik & Kanıt 1