Síťová analýza obohacení drah
Síťová analýza obohacení drah integruje molekulární interakční sítě — interakce protein-protein, signální grafy nebo genové regulační sítě — s omics měřeními k identifikaci biologických drah, které jsou koordinovaně alterovány v dané podmínce. Na rozdíl od klasických přístupů s nadměrnou reprezentací nebo obohacením genových sad, které považují geny v dráze za nezávislé seznamy, tato rodina metod propaguje signály napříč hranami sítě, zachycuje topologii interakcí a odhaluje dysregulované moduly, které by obohacení na základě plochých seznamů minulo.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ porovnat
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →