Genome-wide Complex Trait Analysis for Heritability Estimation
Ústřední otázka, kterou GCTA řeší, zní: jak velká část variability znaku (např. výšky nebo rizika onemocnění) mezi jedinci je způsobena genetickými rozdíly oproti environmentálním faktorům? Studie dvojčat a rodin se touto otázkou zabývají již dlouho, ale směšují účinky sdílených genů a sdíleného prostředí. GCTA funguje odlišně. Využívá celogenomová SNP data k měření genetické podobnosti mezi nepříbuznými jedinci na tisících lokusů současně. Poté se ptá: jsou jedinci, kteří jsou si geneticky podobnější, také podobnější ve svých hodnotách znaku? Pokud ano, naznačuje to genetický vliv. GREML odhaduje dědivost porovnáním pozorované podobnosti znaků mezi jedinci s jejich celogenomovou genetickou příbuzností, vypočtenou ze SNP. Tento přístup je silný, protože využívá stovky tisíc běžných variant, zachycujících kumulativní efekt mnoha lokusů s malým účinkem.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Yang, J., Lee, S. H., Goddard, M. E., & Visscher, P. M. (2011). GCTA: A tool for genome-wide complex trait analysis. American Journal of Human Genetics, 88(1), 76–82. DOI: 10.1016/j.ajhg.2010.11.011 ↗
- Zhou, X., Stephens, M. (2012). Genome-wide efficient mixed-model analysis for association studies. Nature Genetics, 44(7), 821–824. DOI: 10.1038/ng.2310 ↗
- Pitchford, W. S., & Brown, W. M. (2019). Genomic prediction and selection of genomic variance. Genetics Selection Evolution, 51(1), 53–66. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Genome-wide Complex Trait Analysis for Heritability Estimation. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/genetics/gcta
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Statistika F (FST)Genetika↔ compare
- Analýza LD blokůGenetika↔ compare
- Polygenní rizikový skór (PRS)Genetika↔ compare
- Mapování QTLGenetika↔ compare
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →