Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza obohacení drah — Analýza biologického obohacení drah

Analýza obohacení drah (PEA) je statistický přístup, který bere seznam zájmových genů nebo proteinů — typicky odvozený z experimentu s diferenciální expresí nebo proteomickým experimentem — a identifikuje, které předdefinované biologické dráhy nebo funkční genové sady jsou zastoupeny častěji, než by se očekávalo náhodou. Mapováním individuálních molekulárních změn na kurátorované znalostní báze drah, jako jsou KEGG, Gene Ontology nebo Reactome, PEA překládá dlouhé seznamy genů do interpretovatelných biologických procesů, což z ní činí ústřední nástroj v postanalýze experimentů s vysokým propustností omics.

Otevřít v MethodMindJiž brzyVideoJiž brzyDownload slides

Přečíst celou metodu

Pouze pro členy

Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.

Přihlásit se

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Analýza obohacení drah

Analýza obohacení genový…Analýza metabolomiky Síťová analýza obohacení…Proteomická analýza Analýza diferenciální ex…Analýza jednobuněčné RNA…Bayesovské volání vrchol…Bayesovská analýza eQTL Bayesovská analýza oboha…Bayesovská GWAS

+43 more

Zdroje

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Jak citovat tuto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ compare
Analýza metabolomikyBioinformatika↔ compare
Síťová analýza obohacení drahBioinformatika↔ compare
Proteomická analýzaBioinformatika↔ compare
Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ compare

Compare side by side →

Odkazuje sem

Bayesovské volání vrcholů ChIP-seq Bayesovská analýza eQTL Bayesovská analýza obohacení genových sad Bayesovská GWAS Bayesian Metabolomics Analysis Bayesovská analýza obohacení drah Bayesovská analýza proteomiky Bayesovská analýza diferenciální exprese RNA-seq Diferenciální epigenom-široká asociační studie Diferenciální eQTL analýza Analýza diferenciální metabolomiky Diferenciální analýza obohacení drah Diferenciální proteomická analýza Celogenomová asociační studie epigenomu (EWAS)eQTL Analýza Analýza obohacení genových sad (GSEA)Genomová asociační studie (GWAS)Analýza eQTL s podporou strojového učení Analýza obohacení genových sad asistovaná strojovým učením Analýza diverzity mikrobiomu s asistencí strojového učení Analýza diferenciální genové exprese RNA-seq s asistencí strojového učení Analýza jednobuněčné RNA sekvenace (scRNA-seq) s asistencí strojového učení Analýza metabolomiky Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Analýza multi-omických metabolomických dat Víceomická analýza diverzity mikrobiomu Multi-omická proteomická analýza Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Síťová analýza změn počtu kopií genů Síťově orientovaná epigenomově-asociační studie (Network EWAS)Síťová analýza eQTL Síťová analýza obohacení genových sad Síťově orientovaná celogenomová asociační studie (Network-based GWAS)Analýza metabolomiky založená na sítích Analýza diverzity mikrobiomu založená na sítích Síťově orientovaná analýza diferenciální exprese RNA-seq Síťová analýza jednobuněčné RNA-seq Proteomická analýza Analýza diferenciální exprese RNA-seq Analýza eQTL jednotlivých buněk Jednorozměrná analýza obohacení genových sad Jednotlivá-buněčná GWAS Analýza metabolomiky jednotlivých buněk Analýza jednobuněčné RNA-seq Analýza diferenciální exprese genů v jednobuněčné RNA sekvenaci Časově-řádková analýza obohacení genových sad Analýza časových řad metabolomiky Analýza diverzity mikrobiomu v časových řadách Analýza obohacení časových řad pro dráhy Diferenciální exprese časových řad RNA-seq Analýza jednobuněčné RNA-seq v časových řadách

Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →