Analýza variací počtu kopií jediné buňky
Analýza variací počtu kopií jediné buňky (scCNV) detekuje amplifikace a delece genomových segmentů v rámci jednotlivých buněk, což umožňuje výzkumníkům analyzovat intratumorální heterogenitu, rekonstruovat klonální evoluci a rozlišovat maligní od normálních buněk s rozlišením na úrovni jediné buňky. Lze ji aplikovat přímo na data celogenomového sekvenování jediné buňky nebo ji odvodit ze signálů hloubky čtení v experimentech scRNA-seq nebo scATAC-seq.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Analýza variací počtu kopiíBioinformatika↔ porovnat
- Jednobuňková epigenomová asociační studie (scEWAS)Bioinformatika↔ porovnat
- Jednotlivá-buněčná GWASBioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Analýza diferenciální exprese genů v jednobuněčné RNA sekvenaciBioinformatika↔ porovnat
- Volání variantBioinformatika↔ porovnat
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →