Analýza variací počtu kopií — detekce a interpretace CNV
Analýza variací počtu kopií (CNV) je genomický pipeline pro detekci oblastí, kde jedinci nesou méně nebo více kopií segmentu DNA než referenční genom. CNV se rozprostírají od kilobází po megabáze a představují hlavní třídu strukturních variací, které se podílejí na vzniku rakoviny, neurovývojových poruch a diverzity populací. Tento pipeline typicky zpracovává intenzity SNP array nebo signály hloubky čtení z celogenomového sekvenování, aplikuje segmentační algoritmy, volá události zisku a ztráty a anotuje je proti genovým a klinickým databázím.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+9 more
Zdroje
- Redon, R., Ishikawa, S., Fitch, K. R., et al. (2006). Global variation in copy number in the human genome. Nature, 444(7118), 444–454. DOI: 10.1038/nature05329 ↗
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Celogenomová asociační studie epigenomu (EWAS)Bioinformatika↔ compare
- Genomová asociační studie (GWAS)Bioinformatika↔ compare
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Zarovnání sekvencíBioinformatika↔ compare
- Analýza variací počtu kopií jediné buňkyBioinformatika↔ compare
- Volání variantBioinformatika↔ compare
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →