Test HKA
Test Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) je statistická metoda, která testuje neutrální evoluci porovnáním úrovní polymorfismu v rámci populace a divergence mezi populacemi u více lokusů. Tento test, vyvinutý Hudsonem, Kreitmanem a Aguadem v roce 1987, využívá principu, že neutrální lokusy by měly vykazovat očekávané vztahy mezi polymorfismem a divergencí. Lokusy, které se od těchto vztahů odchylují, jsou kandidáty na selekci. Test HKA je obzvláště užitečný pro detekci selekce v celogenomových průzkumech, protože používá relativní srovnání napříč lokusy, nikoli externí kalibraci.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Teorie koalescenceGenetika↔ compare
- Statistika F (FST)Genetika↔ compare
- McDonald-Kreitmanův testGenetika↔ compare
- Selection Sweep (Tajima's D)Genetika↔ compare
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →