Multiomická analýza jednobuněčné RNA-seq – Integrativní multimodální jednobuněčné profilování
Multiomická analýza jednobuněčné RNA-seq integruje dvě nebo více molekulárních vrstev – jako je genová exprese (scRNA-seq), dostupnost chromatinu (scATAC-seq) nebo abundance povrchových proteinů (CITE-seq) – měřených simultánně nebo společně profilovaných ve stejných individuálních buňkách. Zarovnáním těchto modalit do sdíleného nízkorozměrného prostoru získávají výzkumníci mechanisticky bohatší obraz identity buňky, regulačního stavu a fenotypu, než jaký může poskytnout jakýkoli jednotlivý test.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Analýza diferenciální exprese multi-omických dat RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ compare
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ compare
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →