Časově-řádková analýza obohacení genových sad — dynamické obohacení drah v průběhu časových bodů
Časově-řádková analýza obohacení genových sad (TS-GSEA) rozšiřuje klasický rámec GSEA o detekci biologicky koordinovaných genových sad — drah, termínů genové ontologie nebo kurátorovaných podpisů — jejichž kolektivní exprese se smysluplně mění v průběhu času. Místo porovnávání dvou snímků modeluje plnou časovou trajektorii genové exprese, aby identifikovala, které funkční programy jsou aktivovány, potlačeny nebo dynamicky remodelovány během biologického procesu, jako je vývoj, odpověď na léčbu nebo progrese onemocnění.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ porovnat
- Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBioinformatika↔ porovnat
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ porovnat
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Diferenciální exprese časových řad RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
Similar methods
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →