Jednotlivá-buněčná GWAS — Analýza genetických asociací specifických pro buněčné typy
Jednotlivá-buněčná GWAS je integrační bioinformatický pipeline, který mapuje signály studie asociací v celém genomu (GWAS) na krajiny jednobuněčné transkriptomiky, aby identifikoval, které buněčné typy a jednotlivé buňky nesou nepřiměřené genetické riziko pro onemocnění nebo znak. Využitím atlasů jednobuněčné RNA-sekvenace spolu se souhrnnými statistikami GWAS překračuje tkáňové asociace a odhaluje přesné buněčné kontexty, ve kterých genetické varianty asociované s onemocněním působí.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Zhang, M. J., Hou, K., Dey, K. K., Sakaue, S., Jagadeesh, K. A., Weinand, K., ... & Price, A. L. (2022). Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data. Nature Genetics, 54(8), 1224-1234. link ↗
- Bryois, J., Calini, D., Macnair, W., Foo, L., Urich, E., Ortmann, W., ... & De Jager, P. L. (2022). Cell-type-specific cis-eQTLs in eight human brain cell types identify novel risk genes for psychiatric and neurological disorders. Nature Neuroscience, 25(8), 1104-1112. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/single-cell-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- eQTL AnalýzaBioinformatika↔ compare
- Genomová asociační studie (GWAS)Bioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ compare
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Analýza eQTL jednotlivých buněkBioinformatika↔ compare
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ compare
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →