Analýza jednobuněčné RNA-seq v časových řadách — Temporální transkriptomika s jednobuněčným rozlišením
Analýza jednobuněčné RNA-seq v časových řadách zachycuje expresi genů napříč více časovými body s jednobuněčným rozlišením, aby odhalila, jak se buněčné populace objevují, přecházejí a rozcházejí během dynamických biologických procesů, jako je vývoj, diferenciace nebo progrese onemocnění. Kombinací pseudočasového řazení, RNA velocity a testování diferenciální dynamiky rekonstruují výzkumníci časovou trajektorii jednotlivých buněk a identifikují genové regulační změny, které pohánějí biologické přechody.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Analýza variací počtu kopiíBioinformatika↔ porovnat
- eQTL AnalýzaBioinformatika↔ porovnat
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ porovnat
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ porovnat
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
Odkazuje sem
Similar methods
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →