Síťově orientovaná celogenomová asociační studie (Network-based GWAS)
Síťově orientovaná celogenomová asociační studie (Network-based GWAS) integruje výsledky konvenčních celogenomových asociačních studií s biologickými síťovými daty – jako jsou sítě protein-proteinových interakcí (PPI) nebo grafy genové koexprese – za účelem identifikace genových modulů nebo podsítí relevantních pro onemocnění. Namísto reportování pouze nejlepších jednotlivých SNP tento přístup propaguje asociační signály napříč molekulárními interakčními sítěmi a odhaluje shluky genů, jejichž kolektivní signál je zapojuje do biologie komplexních znaků, i když žádná jednotlivá varianta sama o sobě nedosáhne celogenomové významnosti.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/network-based-gwas
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analýza variací počtu kopiíBioinformatika↔ compare
- eQTL AnalýzaBioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Genomová asociační studie (GWAS)Bioinformatika↔ compare
- Síťová analýza eQTLBioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ compare
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →