Volání vrcholů v ChIP-sekvenování jednotlivých buněk — Epigenomické profilování scChIP-seq
Volání vrcholů v ChIP-sekvenování jednotlivých buněk je bioinformatický pipeline, který identifikuje genomové oblasti obohacené o modifikace histonů nebo vazbu transkripčních faktorů v jednotlivých buňkách. Profilováním stavů chromatinu s rozlišením na jednotlivé buňky odhaluje epigenomickou heterogenitu skrytou v experimentech ChIP-sekvenování na hromadných vzorcích, což umožňuje výzkumníkům mapovat regulační krajiny napříč odlišnými populacemi buněk v rámci komplexního tkáňového vzorku.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- ChIP-seq Peak CallingBioinformatika↔ porovnat
- Celogenomová asociační studie epigenomu (EWAS)Bioinformatika↔ porovnat
- Jednobuňková epigenomová asociační studie (scEWAS)Bioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Single-cell Sequence AlignmentBioinformatika↔ porovnat
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →