Analýza Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) je technika a související výpočetní metody pro mapování 3D architektury genomu v buňkách. Vyvinutá Lieberman-Aidenem a Dekkerem v roce 2009, Hi-C identifikuje fyzické interakce mezi genovými oblastmi, které mohou být vzdálené v lineárním pořadí, ale prostorově blízké v 3D jaderném prostoru. Analýza Hi-C odhalila základní principy organizace genomu, včetně existence topologicky asociovaných domén (TADs), a poskytuje vhled do toho, jak 3D struktura reguluje expresi genů a replikaci DNA.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analýza ATAC-seqGenetika↔ compare
- RNA VelocityGenetika↔ compare
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →