Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza obohacení genových sad (GSEA)

Analýza obohacení genových sad (GSEA) je výpočetní metoda, která určuje, zda předdefinovaná sada genů – reprezentující biologickou dráhu, proces nebo funkci – vykazuje statisticky významné, koordinované rozdíly mezi dvěma biologickými stavy. Na rozdíl od jednoduchého filtrování na základě změny exprese (fold-change) pracuje GSEA se všemi měřenými geny seřazenými podle korelační metriky, detekuje jemné, ale konzistentní posuny napříč celou dráhou, i když žádný jednotlivý gen nepřekročí práh významnosti.

Otevřít v MethodMindJiž brzyVideoJiž brzyStáhnout prezentaci

Přečíst celou metodu

Pouze pro členy

Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.

Přihlásit se

Mapa metod

Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.

Analýza obohacení genových sad (GSEA)

Multi-omics Gene Set Enr…Síťová analýza obohacení…Analýza obohacení drah Analýza diferenciální ex…Analýza jednobuněčné RNA…Bayesovská analýza oboha…Bayesovská analýza diver…Bayesovská analýza oboha…Bayesovská analýza difer…Volání diferenciačních v…

+27 dalších

Zdroje

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Jak citovat tuto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Která metoda?

Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.

Multi-omics Gene Set Enrichment AnalysisBioinformatika↔ porovnat
Síťová analýza obohacení genových sadBioinformatika↔ porovnat
Analýza obohacení drahBioinformatika↔ porovnat
Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat

Porovnat vedle sebe →

Odkazuje sem

Bayesovská analýza obohacení genových sad Bayesovská analýza diverzity mikrobiomu Bayesovská analýza obohacení drah Bayesovská analýza diferenciální exprese RNA-seq Volání diferenciačních vrcholů v ChIP-seq Diferenciální analýza obohacení drah eQTL Analýza Analýza obohacení genových sad asistovaná strojovým učením Analýza obohacení drah asistovaná strojovým učením Analýza diferenciální genové exprese RNA-seq s asistencí strojového učení Analýza jednobuněčné RNA sekvenace (scRNA-seq) s asistencí strojového učení Analýza metabolomiky Multi-omics Gene Set Enrichment Analysis Analýza multi-omických metabolomických dat Víceomická analýza diverzity mikrobiomu Vícevrstvá analýza obohacení drah Multi-omická proteomická analýza Analýza diferenciální exprese multi-omických dat RNA-seq Multi-omics single-cell RNA-seq analysis Síťová analýza změn počtu kopií genů Síťová analýza obohacení genových sad Síťově orientovaná celogenomová asociační studie (Network-based GWAS)Analýza metabolomiky založená na sítích Analýza diverzity mikrobiomu založená na sítích Síťová analýza obohacení drah Síťově orientovaná analýza diferenciální exprese RNA-seq Síťová analýza jednobuněčné RNA-seq Analýza obohacení drah Proteomická analýza Analýza diferenciální exprese RNA-seq Jednorozměrná analýza obohacení genových sad Analýza jednobuněčné RNA-seq Analýza diferenciální exprese genů v jednobuněčné RNA sekvenaci Časově-řádková analýza obohacení genových sad Analýza obohacení časových řad pro dráhy Diferenciální exprese časových řad RNA-seq Analýza jednobuněčné RNA-seq v časových řadách

Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →