Diferenciální analýza variací počtu kopií — komparativní analýza CNV / SCNA
Diferenciální analýza variací počtu kopií (dCNV) identifikuje genomové oblasti, kde se počet kopií DNA systematicky liší mezi dvěma stavy — například nádorovou a normální tkání, kohortami případů a kontrol, nebo ošetřenými a neošetřenými buňkami. Kombinací dat o hloubce čtení na úrovni sond nebo intenzity pole s statistickou segmentací a testováním na úrovni skupin, přesně určuje somatické amplifikace a delece, které mohou řídit onemocnění, a rozlišuje opakující se hnací události od náhodného šumu napříč kohortou.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Genomová asociační studie (GWAS)Bioinformatika↔ porovnat
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →