Analýza fylogeneze jednotlivých buněk — rekonstrukce vývojových stromů s rozlišením na úrovni jednotlivých buněk
Fylogenetická analýza jednotlivých buněk rekonstruuje evoluční nebo vývojové stromy z dat sekvenování jednotlivých buněk a sleduje, jak se jednotlivé buňky vyvinuly ze společného předka. Využitím somatických mutací, čipů zavedených pomocí CRISPR nebo změn počtu kopií jako dědičných znaků tato metoda mapuje klonální vztahy v rámci nádorů, vyvíjejících se tkání nebo imunitních repertoárů s bezprecedentním buněčným rozlišením.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Analýza variací počtu kopiíBioinformatika↔ porovnat
- Fylogenetická analýzaBioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Volání variantBioinformatika↔ porovnat
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →