Volání variant v časových řadách — detekce longitudinálních somatických mutací

Volání variant v časových řadách je bioinformatický pipeline, který identifikuje a sleduje genomové varianty — typicky somatické mutace — napříč více sekvenačními vzorky odebranými od stejného subjektu v různých časových bodech. Nejčastěji se používá v nádorové genomice k rekonstrukci evoluce nádoru, monitorování minimální reziduální nemoci a detekci vzniku klonů rezistentních vůči terapii. Společným modelováním frekvencí alelických variant v časové dimenzi tato metoda rozlišuje skutečné somatické změny od šumu při sekvenování a odhaduje klonální dynamiku v průběhu času.