Topologie PPI sítí
Analýza sítí protein-proteinových interakcí identifikuje a charakterizuje strukturní vlastnosti buněčných interakčních sítí. Tento přístup, iniciovaný Uetzem a kolektivem prostřednictvím rozsáhlého screeningu metodou kvasinkových dvouhybridů, odhaluje topologické rysy, jako jsou centra (hubs), moduly a motivy, které kódují funkční organizaci a asociace s onemocněními.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/ppi-network-topology
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Rekonstrukce pomocí kryo-EMBioinformatika↔ porovnat
- Vyhledávání profilů HMMERBioinformatika↔ porovnat
- Molekulární dokováníBioinformatika↔ porovnat
Odkazuje sem
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →