Diferenciální analýza jednobuněčné RNA-seq

Diferenciální analýza jednobuněčné RNA-seq (scRNA-seq) je výpočetní postup, který porovnává transkriptomické profily napříč biologickými podmínkami – jako je ošetřené versus neošetřené, nemocné versus zdravé, nebo časové body – s rozlišením na úrovni jednotlivých buněk. Identifikuje, které geny, buněčné typy a buněčné stavy se mění mezi podmínkami, a poskytuje mechanistický vhled, který srovnání hromadné RNA-seq nemůže nabídnout. Přístup kombinuje shlukování, anotaci buněčných typů a statistické testování, typicky s použitím pseudohromadné agregace pro zohlednění korelace v rámci vzorku.