Process / pipelineBioinformatics / omics

Analýza metabolomiky s asistencí strojového učení

Analýza metabolomiky s asistencí strojového učení (ML) je integrační bioinformatický pipeline, který spojuje netargetované nebo cílené profilování metabolitů – prostřednictvím hmotnostní spektrometrie nebo NMR – s řízenými a neřízenými ML algoritmy k objevování biomarkerů, klasifikaci fenotypů a modelování metabolických stavů. Zpracováním extrémní dimenzionality a kolinearity inherentní v metabolomických datasetech (stovky až tisíce příznaků, desítky až stovky vzorků) metody ML, jako jsou náhodné lesy, podpůrné vektorové stroje a neuronové sítě, extrahují biologicky interpretovatelné vzory, které klasická univariátní statistika běžně přehlíží.

Otevřít v MethodMindJiž brzyVideoJiž brzyDownload slides

Přečíst celou metodu

Pouze pro členy

Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.

Přihlásit se

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Zdroje

  1. Liebal, U. W., Phan, A. N. T., Sudhakar, M., Raman, K., & Blank, L. M. (2020). Machine learning applications for mass spectrometry-based metabolomics. Metabolites, 10(6), 243. DOI: 10.3390/metabo10060243
  2. Bylesjö, M., Rantalainen, M., Cloarec, O., Nicholson, J. K., Holmes, E., & Trygg, J. (2006). OPLS discriminant analysis: combining the strengths of PLS-DA and SIMCA classification. Journal of Chemometrics, 20(8-10), 341-351. link

Jak citovat tuto stránku

ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Metabolomics Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/machine-learning-assisted-metabolomics-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Odkazuje sem

ScholarGateMachine learning-assisted metabolomics analysis (Machine Learning-Assisted Metabolomics Analysis). Získáno 2026-06-15 z https://scholargate.app/cs/bioinformatics/machine-learning-assisted-metabolomics-analysis · Datová sada: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026