Síťová analýza jednobuněčné RNA-seq
Síťová analýza jednobuněčné RNA-seq rozšiřuje standardní pracovní postupy scRNA-seq o konstrukci a zkoumání sítí molekulárních interakcí — genových regulačních sítí, sítí koexprese genů nebo grafů mezibuněčné komunikace — z jednobuněčných transkriptomických dat. Namísto nezávislého zpracování každého genu tento přístup zachycuje koordinovanou aktivitu genových obvodů a mezibuněčných signálních drah v rámci populací buněk i mezi nimi, což umožňuje pohled na transkripční regulaci na systémové úrovni s rozlišením na úrovni jednotlivých buněk.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Zdroje
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analýza obohacení genových sad (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Síťově orientovaná analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ compare
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ compare
- Analýza eQTL jednotlivých buněkBioinformatika↔ compare
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ compare
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →