Analýza diverzity mikrobiomu v časových řadách — Analýza diverzity mikrobiomu v longitudinálním pojetí
Analýza diverzity mikrobiomu v časových řadách sleduje, jak se bohatost, rovnoměrnost a složení komunity mikrobiálních společenstev mění v průběhu více časových bodů u stejných subjektů. Kombinací standardních metrik diverzity s longitudinálními statistickými modely odděluje skutečné časové dynamiky od mezisubjektové variability, přičemž identifikuje, kdy a jak poruchy, jako jsou změny stravy, léčba antibiotiky nebo nástup onemocnění, přetvářejí mikrobiom.
Přečíst celou metodu
Pro přečtení této sekce se přihlaste s bezplatným účtem.
Mapa metod
Okolí příbuzných metod — vyberte uzel, který chcete prozkoumat.
Zdroje
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Jak citovat tuto stránku
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/cs/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Která metoda?
Postavte tuto metodu vedle jejích nejbližších příbuzných a čtěte je vedle sebe — knihovna položí knihy na stůl; volba je na vás.
- Víceomická analýza diverzity mikrobiomuBioinformatika↔ porovnat
- Analýza obohacení drahBioinformatika↔ porovnat
- Analýza diferenciální exprese RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Analýza jednobuněčné RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
- Diferenciální exprese časových řad RNA-seqBioinformatika↔ porovnat
Similar methods
Našli jste na této stránce chybu? Nahlaste ji nebo navrhněte opravu →