Yapay Zekâ

112 metoda u ovoj porodici.

Izdvojeno

Analiza mešavineAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, Stephe Rekonstrukcija stanja predakaAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns of ATAC-seq analizaATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and c ChIP-seq analiza poziva na vrhoveChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based Koalescentna teorijaCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John Kingma Analiza varijacija broja kopijaCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

Put čitanja

Najreferentnije temeljne metode ove teme, prema redosledu njihovog nastanka — mesto za početak ako ste novi ovde.

Analiza varijacija broja kopija1998–2006autor Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
Analiza obogaćenosti puta2003–2005autor Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)autor Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
Геномска студија асоцијација (GWAS)2005–2007autor Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
Studija asocijacije na nivou celog epigenoma (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)autor Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
RNA-seq Differential Expression2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)autor Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
Analiza jednoćelijske RNA-sekvence2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016autor Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
Позивање варијанти2009–2010 (modern high-throughput era)autor Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)

sve metode na ovoj polici ↓

Sve metode 112

Analiza mešavine Rekonstrukcija stanja predaka ATAC-seq analiza ChIP-seq analiza poziva na vrhove Koalescentna teorija Analiza varijacija broja kopija Analiza CRISPR skrininga Rekonstrukcija u krio-EM-u De Novo asembliranje transkriptoma Diferencijalno pozivanje vrhova u ChIP-seq analizi Analiza diferencijalne varijacije broja kopija -Diferencijalna analiza eQTL Diferencijalna metabolomika Analiza diferencijalne obogaćenosti puteva Diferencijalna proteomska analiza Diferencijalna analiza RNK sekvenciranja jednоćelijskih uzoraka Differential Variant Calling Studija asocijacije na nivou celog epigenoma (EWAS)Epigenome-Wide Association Study u obrazovnom istraživanju Analiza eQTL F-statistike (FST)GCTA Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Геномска студија асоцијација (GWAS)Genomsko-asocijativno istraživanje (GWAS) u obrazovnim istraživanjima Analiza Hi-C HKA test Pretraga HMMER profila Modelovanje homologije IBD mapiranje Analiza LD blokova Mašinsko učenje-potpomognuto pozivanje vrhova ChIP-seq Analiza varijacija broja kopija potpomognuta mašinskim učenjem ML-potpomognuta epigenom-široka asocijaciona studija (ML-EWAS)Analiza eQTL potpomognuta mašinskim učenjem Analiza obogaćenosti genskih skupova potpomognuta mašinskim učenjem ML-GWAS (Genomsko-asocijativna studija uz pomoć mašinskog učenja)Analiza metabolomike potpomognuta mašinskim učenjem Analiza diverziteta mikrobioma uz pomoć mašinskog učenja Analiza obogaćivanja puteva potpomognuta mašinskim učenjem Analiza filogenetskih stabala uz pomoć mašinskog učenja Machine learning-assisted RNA-seq differential expression Машинско учење потпомогнуто поравнање секвенци Analiza jednoćelijske RNA-sekvence (scRNA-seq) uz pomoć mašinskog učenja Analiza varijanti uz pomoć mašinskog učenja MK test Analiza metabolomike Metagenomic Binning Molekulsko spajanje Študija asocijacije na nivou epigenoma sa multi-omika pristupom Višestruka omika analiza eQTL Multi-omics gene set enrichment analysis Multi-omika analiza metabolomike Analiza raznolikosti mikrobioma korišćenjem više omika Analiza obogaćenosti puteva višestrukih omika Вишеомска филогенетска анализа Multi-omics analiza proteoma Analiza diferencijalne ekspresije multi-omskih RNA-seq podataka Analiza jednoćelijske RNA-sekvenciranja više omika Analiza varijacija broja kopija zasnovana na mreži Mrežna studija asocijacija na nivou epigenoma (Network EWAS)Mrežno zasnovana eQTL analiza Mrežna studija genskih asocijacija Mrežna analiza metaboloma Analiza raznolikosti mikrobioma zasnovana na mrežama Mrežna analiza obogaćenosti puteva Mrežna filogenetska analiza Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq podataka Mrežna analiza jedn ćelijske RNA-seq ekspresije Mrežni pristup pozivanju varijanti Analiza obogaćenosti puta Farmakoforno modelovanje Filogenetička analiza Filogenetski nezavisni kontrasti Poligeni skor rizika Topologija PPI mreže Proteomska analiza QSAR QTL Mapping RNA Velocity RNA-seq Differential Expression Selekcijski zamah (Tajima-in D)Sequence Alignment Позивање врхова у једноћелијском ChIP-seq-у Analiza varijacija broja kopija na nivou pojedinačnih ćelija Jednoćelijska epigenom-široka studija asocijacija (scEWAS)Analiza eQTL na nivou jedne ćelije Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Jednoćelijska GWAS Analiza metabolomike pojedinačnih ćelija Analiza diverziteta mikrobioma na nivou pojedinačnih ćelija Analiza filogenetskih podataka jedne ćelije Analiza jednoćelijske RNA-sekvence Analiza diferencijalne ekspresije u jednoj ćelijskoj RNK-sekvenci Jednoćelijsko poravnavanje sekvenci Pozivanje varijanti pojedinačnih ćelija Pozivanje vrhova u vreme-serijskim ChIP-seq podacima Analiza vremenskih serija varijacija broja kopija Vremenska epigenom-široka studija asocijacija Analiza vremenskih serija eQTL Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza metabolomike u vremenskim serijama Analiza vremenskih serija raznolikosti mikrobioma Analiza obogaćenosti vremenskih nizova puteva Vremenska filogenetska analiza Analiza proteoma u vremenskom nizu Vremenska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka Analiza jednočelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama Висoко-временски позив за варијанте Test disequilibrium prenosa Позивање варијанти

Još u Nauke o životu

İstatistik 21 Karar Bilimleri 7 Ölçme & Psikometri 122 Nedensellik & Kanıt 1