Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA) je računarska metoda koja utvrđuje da li definisani skup gena — koji predstavlja biološki put, proces ili funkciju — pokazuje statistički značajne, koordinisane razlike između dva biološka stanja. Za razliku od jednostavnog filtriranja po promeni jačine (fold-change), GSEA operiše na svim merenim genima rangiranim prema metriku korelacije, detektujući suptilne ali konzistentne pomake duž celog puta čak i kada nijedan pojedinačni gen ne prođe prag značajnosti.

Otvorite u MethodMindUskoroApply, compare, get guidance

Tools & resources

Preuzmi slajdove

Learn & explore

VideoUskoro

Pročitajte celu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.

Prijavite se

Mapa metoda

Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)

Multi-omics gene set enr…Mrežna analiza obogaćeno…Analiza obogaćenosti puta RNA-seq Differential Exp…Analiza jednoćelijske R…Bayesian analiza obogaći…Bayesian analiza raznoli…Bajezijanska analiza obo…Bajevska analiza diferen…Diferencijalno pozivanje…

+27 još

Izvori

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Mootha, V. K., Lindgren, C. M., Eriksson, K. F., Subramanian, A., Sihag, S., Lehar, J., Puigserver, P., Carlsson, E., Ridderstrale, M., Laurila, E., Houstis, N., Daly, M. J., Patterson, N., Mesirov, J. P., Golub, T. R., Tamayo, P., Spiegelman, B., Lander, E. S., Hirschhorn, J. N., Altshuler, D., & Groop, L. C. (2003). PGC-1alpha-responsive genes involved in oxidative phosphorylation are coordinately downregulated in human diabetes. Nature Genetics, 34(3), 267–273. DOI: 10.1038/ng1180 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/gene-set-enrichment-analysis

Koja metoda?

Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.

Multi-omics gene set enrichment analysisBioinformatika↔ uporedi
Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupovaBioinformatika↔ uporedi
Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi

Uporedi uporedo →

Citirana u

Bayesian analiza obogaćivanja genskih skupova Bayesian analiza raznolikosti mikrobioma Bajezijanska analiza obogaćenja puteva Bajevska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka Diferencijalno pozivanje vrhova u ChIP-seq analizi Analiza diferencijalne obogaćenosti puteva Analiza eQTL Analiza obogaćenosti genskih skupova potpomognuta mašinskim učenjem Analiza obogaćivanja puteva potpomognuta mašinskim učenjem Machine learning-assisted RNA-seq differential expression Analiza jednoćelijske RNA-sekvence (scRNA-seq) uz pomoć mašinskog učenja Analiza metabolomike Multi-omics gene set enrichment analysis Multi-omika analiza metabolomike Analiza raznolikosti mikrobioma korišćenjem više omika Analiza obogaćenosti puteva višestrukih omika Multi-omics analiza proteoma Analiza diferencijalne ekspresije multi-omskih RNA-seq podataka Analiza jednoćelijske RNA-sekvenciranja više omika Analiza varijacija broja kopija zasnovana na mreži Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova Mrežna studija genskih asocijacija Mrežna analiza metaboloma Analiza raznolikosti mikrobioma zasnovana na mrežama Mrežna analiza obogaćenosti puteva Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq podataka Mrežna analiza jedn ćelijske RNA-seq ekspresije Analiza obogaćenosti puta Proteomska analiza RNA-seq Differential Expression Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Analiza jednoćelijske RNA-sekvence Analiza diferencijalne ekspresije u jednoj ćelijskoj RNK-sekvenci Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza obogaćenosti vremenskih nizova puteva Vremenska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka Analiza jednočelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network Analysis Functional Genomics and Pathway Analysis Gene Ontology and Biological Databases Gene Expression Signatures and Prognostic Markers Transcriptomics and Gene Expression Analysis Systems Genomics and Network Biology

Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →