Позивање врхова у једноћелијском ChIP-seq-у — Епигеномско профилисање једноћелијског ChIP-seq-а
Позивање врхова у једноћелијском ChIP-seq-у је биоинформатички пакет који идентификује геномске регионе обогаћене модификацијама хистона или везивањем фактора транскрипције у појединачним ћелијама. Профилишући стања хроматина са резолуцијом појединачних ћелија, открива епигеномску хетерогеност скривену у експериментима масовног ChIP-seq-а, омогућавајући истраживачима да мапирају регулаторне пејзаже кроз различите популације ћелија унутар комплексног узорка ткива.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link ↗
- Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- ChIP-seq analiza poziva na vrhoveBioinformatika↔ uporedi
- Studija asocijacije na nivou celog epigenoma (EWAS)Bioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijska epigenom-široka studija asocijacija (scEWAS)Bioinformatika↔ uporedi
- Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijsko poravnavanje sekvenciBioinformatika↔ uporedi
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →