Analiza jednočelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama — Temporalna transkriptomika na rezoluciji jedne ćelije
Analiza jedn ćelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama beleži ekspresiju gena u više vremenskih tačaka na rezoluciji jedne ćelije kako bi se otkrilo kako populacije ćelija nastaju, prelaze i razdvajaju se tokom dinamičkih bioloških procesa kao što su razvoj, diferencijacija ili napredovanje bolesti. Kombinovanjem pseudovremenskog sortiranja, RNA brzine i testiranja diferencijalne dinamike, istraživači rekonstruišu temporalnu putanju pojedinačnih ćelija i identifikuju regulatorne promene gena koje pokreću biološke tranzicije.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ uporedi
- Analiza eQTLBioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
- Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →