Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama — dinamička obogaćenost puteva kroz vremenske tačke
Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama (TS-GSEA) proširuje klasični GSEA okvir za detekciju biološki koordinisanih genskih skupova — puteva, termina Gensko ontologije ili kuriranih potpisa — čije kolektivne ekspresije se značajno menjaju tokom vremena. Umesto poređenja dva snimka, modelira punu vremensku putanju ekspresije gena kako bi identifikovala koje funkcionalne programe se aktiviraju, potiskuju ili dinamički remodeluju tokom biološkog procesa kao što su razvoj, odgovor na terapiju ili progresija bolesti.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
- Multi-omics gene set enrichment analysisBioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
- Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi
- Vremenska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podatakaBioinformatika↔ uporedi
Similar methods
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →