Analiza Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) je tehnika i prateće računarske metode za mapiranje 3D arhitekture genoma unutar ćelija. Razvijen od strane Lieberman-Aiden i Dekker 2009. godine, Hi-C identifikuje fizičke interakcije između genomičkih regiona koji mogu biti udaljeni u linearnom nizu, ali prostorno bliski u 3D nuklearnom prostoru. Analiza Hi-C je otkrila fundamentalne principe organizacije genoma, uključujući postojanje topološki udruženih domena (TADs), i pruža uvid u to kako 3D struktura reguliše ekspresiju gena i replikaciju DNK.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq analizaGenetika↔ compare
- RNA VelocityGenetika↔ compare
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →