Topologija PPI mreže
Analiza mreže interakcija protein-protein (PPI) identifikuje i karakteriše strukturna svojstva ćelijskih interakcionih mreža. Pionirski rad Uetza i kolega, kroz skrining kvasca metodom dvostrukog hibrida velikog obima, otkrio je topološke karakteristike kao što su čvorišta, moduli i motivi koji kodiraju funkcionalnu organizaciju i veze sa bolestima.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/ppi-network-topology
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Rekonstrukcija u krio-EM-uBioinformatika↔ uporedi
- Pretraga HMMER profilaBioinformatika↔ uporedi
- Molekulsko spajanjeBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →