Analiza filogenetskih podataka jedne ćelije — Rekonstrukcija stabla loze pri rezoluciji jedne ćelije
Analiza filogenetskih podataka jedne ćelije rekonstruiše evolutivna ili razvojna stabla iz podataka sekvenciranja jedne ćelije, prateći kako su se individualne ćelije razgranale od zajedničkog pretka. Korišćenjem somatskih mutacija, bar-kodova uvedenih CRISPR-om ili promena broja kopija kao naslednih osobina, ova metoda mapira klonske odnose unutar tumora, razvijajućih tkiva ili imunskih repertoara sa neviđenom ćelijskom rezolucijom.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ compare
- Filogenetička analizaBioinformatika↔ compare
- Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ compare
- Позивање варијантиBioinformatika↔ compare
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →