Mrežna analiza obogaćenosti puteva
Mrežna analiza obogaćenosti puteva integriše mreže molekularnih interakcija — interakcije protein-protein, signalne grafove ili gen-regulatorne mreže — sa omikama merenjima radi identifikacije bioloških puteva koji su koordinisano izmenjeni u određenom stanju. Za razliku od klasičnih pristupa prekomerne zastupljenosti ili obogaćenosti skupa gena, koji tretiraju gene puta kao nezavisne liste, ova porodica metoda propagira signale preko mrežnih veza, obuhvatajući topologiju interakcija i otkrivajući disregulirane module koje obogaćenost ravnim listama ne bi uočila.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →