HKA test
Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) test je statistička metoda koja testira neutralnu evoluciju upoređivanjem nivoa polimorfizma unutar populacije i divergencije između populacija na više lokusa. Razvijen od strane Hudsona, Kreitmana i Aguadea 1987. godine, ovaj test koristi princip da neutralni lokusi treba da pokažu očekivane odnose između polimorfizma i divergencije. Lokusi koji odstupaju od ovih odnosa su kandidati za selekciju. HKA test je posebno koristan za detekciju selekcije u genomičkim pregledima jer koristi relativna poređenja među lokusima umesto da zahteva eksternu kalibraciju.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Koalescentna teorijaGenetika↔ compare
- F-statistike (FST)Genetika↔ compare
- MK testGenetika↔ compare
- Selekcijski zamah (Tajima-in D)Genetika↔ compare
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →