Висoко-временски позив за варијанте — детекција соматских мутација у лонгитудиналном праћењу

Висoко-временски позив за варијанте је биоинформатички пакет који идентификује и прати геномске варијанте — типично соматске мутације — преко више узорака секвенцирања прикупљених од истог субјекта у различитим временским тачкама. Најшире се примењује у канцерској геномици за реконструкцију еволуције тумора, праћење минималне резидуалне болести и детекцију појаве клонова отпорних на терапију. Заједничким моделовањем учесталости алела варијанти преко временске димензије, метода разликује праве соматске промене од шума секвенцирања и процењује клоналну динамику током времена.