Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza obogaćenosti puta — Biološka analiza obogaćenosti puta

Analiza obogaćenosti puta (PEA) je statistički pristup koji uzima listu gena ili proteina od interesa — tipično izvedenu iz eksperimenta diferencijalne ekspresije ili proteomike — i identifikuje koje su unapred definisani biološki putevi ili funkcionalne grupe gena zastupljene češće nego što se očekuje slučajno. Mapiranjem pojedinačnih molekularnih promena na kurirane baze znanja o putevima kao što su KEGG, Gene Ontology ili Reactome, PEA prevodi duge liste gena u interpretativne biološke procese, čineći je centralnim alatom u postanalizi eksperimenata visoke propusnosti omika.

Otvorite u MethodMindUskoroVideoUskoroPreuzmi slajdove

Pročitajte celu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.

Prijavite se

Mapa metoda

Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.

Analiza obogaćenosti puta

Analiza obogaćenja gensk…Analiza metabolomike Mrežna analiza obogaćeno…Proteomska analiza RNA-seq Differential Exp…Analiza jednoćelijske R…Bayesian ChIP-seq Peak C…Bajezijanska eQTL analiza Bayesian analiza obogaći…Bajezijanska GWAS

+43 još

Izvori

Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Koja metoda?

Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
Analiza metabolomikeBioinformatika↔ uporedi
Mrežna analiza obogaćenosti putevaBioinformatika↔ uporedi
Proteomska analizaBioinformatika↔ uporedi
RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi

Uporedi uporedo →

Citirana u

Bayesian ChIP-seq Peak Calling Bajezijanska eQTL analiza Bayesian analiza obogaćivanja genskih skupova Bajezijanska GWAS Bajezijanska metabolomska analiza Bajezijanska analiza obogaćenja puteva Analiza proteoma zasnovana na Bayesovom teoremu Bajevska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka -Diferencijalna analiza eQTL Diferencijalna metabolomika Analiza diferencijalne obogaćenosti puteva Diferencijalna proteomska analiza Studija asocijacije na nivou celog epigenoma (EWAS)Analiza eQTL Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Геномска студија асоцијација (GWAS)Analiza eQTL potpomognuta mašinskim učenjem Analiza obogaćenosti genskih skupova potpomognuta mašinskim učenjem Analiza diverziteta mikrobioma uz pomoć mašinskog učenja Machine learning-assisted RNA-seq differential expression Analiza jednoćelijske RNA-sekvence (scRNA-seq) uz pomoć mašinskog učenja Analiza metabolomike Študija asocijacije na nivou epigenoma sa multi-omika pristupom Multi-omics gene set enrichment analysis Multi-omika analiza metabolomike Analiza raznolikosti mikrobioma korišćenjem više omika Multi-omics analiza proteoma Analiza jednoćelijske RNA-sekvenciranja više omika Analiza varijacija broja kopija zasnovana na mreži Mrežna studija asocijacija na nivou epigenoma (Network EWAS)Mrežno zasnovana eQTL analiza Mrežna analiza obogaćenosti genskih skupova Mrežna studija genskih asocijacija Mrežna analiza metaboloma Analiza raznolikosti mikrobioma zasnovana na mrežama Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq podataka Mrežna analiza jedn ćelijske RNA-seq ekspresije Proteomska analiza RNA-seq Differential Expression Analiza eQTL na nivou jedne ćelije Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Jednoćelijska GWAS Analiza metabolomike pojedinačnih ćelija Analiza jednoćelijske RNA-sekvence Analiza diferencijalne ekspresije u jednoj ćelijskoj RNK-sekvenci Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza metabolomike u vremenskim serijama Analiza vremenskih serija raznolikosti mikrobioma Analiza obogaćenosti vremenskih nizova puteva Vremenska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka Analiza jednočelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama

Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →