Analiza varijacija broja kopija zasnovana na mreži
Analiza varijacija broja kopija (CNV) zasnovana na mreži integriše genomske podatke o CNV sa biološkim mrežama interakcija — kao što su mreže interakcija protein-protein (PPI) ili mrežne putanje — radi identifikacije funkcionalno koherentnih regiona, gena pokretača i izmenjenih podsistema koje samo sirovo pozivanje CNV ne bi otkrilo. Propagiranjem CNV signala kroz graf mreže, metoda otkriva koordinisane imbalanse genomske doze koji se konvergiraju na zajedničke biološke funkcije, što je čini posebno moćnom u kancerogenomici i studijama retkih bolesti.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Izvori
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ compare
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ compare
- Mrežna studija genskih asocijacijaBioinformatika↔ compare
- Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq podatakaBioinformatika↔ compare
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ compare
- Позивање варијантиBioinformatika↔ compare
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →