Analiza raznolikosti mikrobioma korišćenjem više omika
Analiza raznolikosti mikrobioma korišćenjem više omika integriše dva ili više sloja omika podataka — kao što su metagenomika, metatranskriptomika, metabolomika i metaproteomika — radi karakterizacije i sastava i funkcionalne aktivnosti mikrobijalnih zajednica. Povezivanjem metrika raznolikosti taksona sa podacima molekularnog fenotipa, pristup otkriva kako se struktura zajednice prevodi u ekološke funkcije relevantne za domaćina, koje nijedan pojedinačni omika sloj samostalno ne može otkriti.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Rohart, F., Gautier, B., Singh, A., & Le Cao, K.-A. (2017). mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration. PLOS Computational Biology, 13(11), e1005752. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005752 ↗
- Argelaguet, R., Velten, B., Arnol, D., Dietrich, S., Zenz, T., Marioni, J. C., Buettner, F., Huber, W., & Stegle, O. (2018). Multi-Omics Factor Analysis — a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets. Molecular Systems Biology, 14(6), e8124. DOI: 10.15252/msb.20178124 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/multi-omics-microbiome-diversity-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
- Analiza metabolomikeBioinformatika↔ uporedi
- Multi-omika analiza metabolomikeBioinformatika↔ uporedi
- Analiza raznolikosti mikrobioma zasnovana na mrežamaBioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →