Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis
Klasični GSEA postavlja pitanje da li se unapred definisani skup gena (npr. poznati metabolički put) ima tendenciju da se grupiše na vrhu ili dnu rangirane liste diferencijalno eksprimiranih gena. Višeomsko GSEA proširuje ovu ideju: umesto jedne rangirane liste, donosite rangirane dokaze iz merenja RNK, proteina i metabolita i pitate se koji su putevi dosledno obogaćeni — ili osiromašeni — preko sve tri. Rezultat je kraća lista puteva podržana sa više nezavisnih molekularnih slojeva, što čini biološke zaključke daleko robusnijim nego analiza sa jedne platforme.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Meng, C., Zeleznik, O. A., Thallinger, G. G., Kuster, B., Gholami, A. M., & Culhane, A. C. (2016). Dimension reduction techniques for the integrative analysis of multi-omics data. Briefings in Bioinformatics, 17(4), 628–641. DOI: 10.1093/bib/bbv108 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/multi-omics-gene-set-enrichment-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti puteva višestrukih omikaBioinformatika↔ uporedi
- Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ uporedi
- Proteomska analizaBioinformatika↔ uporedi
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupovaBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Similar methods
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →