Process / pipelineBioinformatics / omics

Analiza jednoćelijske RNA-sekvence — scRNA-seq

Analiza jednoćelijske RNA-sekvence (scRNA-seq) karakteriše ekspresiju gena na rezoluciji pojedinačnih ćelija, omogućavajući otkriće tipova, stanja i tranzicija ćelija koje su nevidljive u ukupnoj transkriptomici. Počevši od sirovih sekvenciranih zapisa, radni tok proizvodi matricu brojanja ćelija po genu i nastavlja se kroz kontrolu kvaliteta, normalizaciju, redukciju dimenzionalnosti, nenadgledano klasterovanje, anotaciju tipa ćelija i niz naknadnih analiza kao što su inferencija trajektorije i diferencijalna ekspresija između populacija ćelija.

Otvorite u MethodMindUskoroVideoUskoroDownload slides

Pročitajte celu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.

Prijavite se

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Analiza jednoćelijske RNA-sekvence

Analiza obogaćenja gensk…Analiza obogaćenosti puta RNA-seq Differential Exp…Analiza eQTL na nivou je…Pozivanje varijanti poje…Bajevska analiza diferen…ChIP-seq analiza poziva…Diferencijalna analiza R…Analiza eQTL Mašinsko učenje-potpomog…

+19 more

Izvori

Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Bioinformatika↔ compare
Analiza obogaćenosti putaBioinformatika↔ compare
RNA-seq Differential ExpressionBioinformatika↔ compare
Analiza eQTL na nivou jedne ćelijeBioinformatika↔ compare
Pozivanje varijanti pojedinačnih ćelijaBioinformatika↔ compare

Compare side by side →

Citirana u

Bajevska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka ChIP-seq analiza poziva na vrhove Diferencijalna analiza RNK sekvenciranja jednоćelijskih uzoraka Analiza eQTL Analiza obogaćenja genskih skupova (GSEA)Mašinsko učenje-potpomognuto pozivanje vrhova ChIP-seq Analiza obogaćenosti genskih skupova potpomognuta mašinskim učenjem Machine learning-assisted RNA-seq differential expression Analiza jednoćelijske RNA-sekvence (scRNA-seq) uz pomoć mašinskog učenja Analiza jednoćelijske RNA-sekvenciranja više omika Mrežna analiza diferencijalne ekspresije RNA-seq podataka Mrežna analiza jedn ćelijske RNA-seq ekspresije Analiza obogaćenosti puta RNA-seq Differential Expression Sequence Alignment Позивање врхова у једноћелијском ChIP-seq-у Analiza varijacija broja kopija na nivou pojedinačnih ćelija Analiza eQTL na nivou jedne ćelije Jednoćelijska analiza obogaćenosti genskih skupova Jednoćelijska GWAS Analiza metabolomike pojedinačnih ćelija Analiza diverziteta mikrobioma na nivou pojedinačnih ćelija Analiza filogenetskih podataka jedne ćelije Analiza diferencijalne ekspresije u jednoj ćelijskoj RNK-sekvenci Analiza obogaćenosti genskih skupova u vremenskim serijama Analiza vremenskih serija raznolikosti mikrobioma Vremenska analiza diferencijalne ekspresije gena iz RNA-seq podataka Analiza jednočelijske RNA-seq sekvence u vremenskim serijama

Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →