Analiza varijacija broja kopija na nivou pojedinačnih ćelija
Analiza varijacija broja kopija na nivou pojedinačnih ćelija (scCNV) detektuje dobitke i gubitke genomskih segmenata unutar individualnih ćelija, omogućavajući istraživačima da razreše intratumorsku heterogenost, rekonstruišu klonsku evoluciju i razlikuju maligne od normalnih ćelija sa rezolucijom pojedinačne ćelije. Može se primeniti direktno na podatke sekvenciranja celog genoma pojedinačnih ćelija ili se može inferirati iz signala dubine čitanja u scRNA-seq ili scATAC-seq eksperimentima.
Pročitajte celu metodu
Prijavite se besplatnim nalogom da biste pročitali ovaj odeljak.
Mapa metoda
Okruženje srodnih metoda — izaberite čvor da biste istraživali.
Izvori
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sr/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu pored njoj najbližih srodnika i čitajte ih uporedo — biblioteka polaže knjige na sto; izbor je na vama.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijska epigenom-široka studija asocijacija (scEWAS)Bioinformatika↔ uporedi
- Jednoćelijska GWASBioinformatika↔ uporedi
- Analiza jednoćelijske RNA-sekvenceBioinformatika↔ uporedi
- Analiza diferencijalne ekspresije u jednoj ćelijskoj RNK-sekvenciBioinformatika↔ uporedi
- Позивање варијантиBioinformatika↔ uporedi
Citirana u
Uočili ste grešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravku →