Yapay Zekâ

112 שיטות במשפחה זו.

נבחרות

ניתוח תערובת אוכלוסיות (Admixture Analysis)Admixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, Stephe שחזור מצב קדמוןAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns of ניתוח ATAC-seqATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and c קריאת שיאי ChIP-seqChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based תאוריית הקואלסנציהCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John Kingma ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)Copy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

מסלול קריאה

השיטות היסודיות המצוטטות ביותר בנושא זה, לפי סדר התפתחותן — נקודת פתיחה למי שחדש כאן.

ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)1998–2006מאת Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
ניתוח העשרת מסלולים2003–2005מאת Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)מאת Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
מחקר השוואתי של כלל הגנום (GWAS)2005–2007מאת Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
מחקר אסוציאציות אפי-גנום-רחב (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)מאת Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)מאת Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
ניתוח RNA-seq של תא בודד2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016מאת Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
קריאת וריאנטים2009–2010 (modern high-throughput era)מאת Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)

כל השיטות במדף זה ↓

כל השיטות 112

ניתוח תערובת אוכלוסיות (Admixture Analysis)שחזור מצב קדמון ניתוח ATAC-seq קריאת שיאי ChIP-seq תאוריית הקואלסנציה ניתוח שונות מספר העתקים (CNV)ניתוח מסכי CRISPR שחזור קריו-EM הרכבת טרנסקריפטום דה נובו קריאת פסגות (peak calling) דיפרנציאלית ב-ChIP-seq ניתוח דיפרנציאלי של שונות במספר העותקים סקר אפיגנום-רחב דיפרנציאלי ניתוח דיפרנציאלי של eQTL ניתוח מטבולומי דיפרנציאלי ניתוח העשרה דיפרנציאלי של מסלולים ניתוח פרוטאומיקה דיפרנציאלי ניתוח RNA-seq דיפרנציאלי ברמת התא הבודד זיהוי וריאנטים דיפרנציאלי – איתור וריאנטים סומטיים השוואתי מחקר אסוציאציות אפי-גנום-רחב (EWAS)מחקר אסוציאציות אפי-גנומי רחב-היקף (EWAS) במחקר חינוכי ניתוח eQTL סטטיסטיקות F (FST)GCTA ניתוח העשרת קבוצת גנים (GSEA)מחקר השוואתי של כלל הגנום (GWAS)מחקר אסוציאציות גנום-רחב במחקר חינוכי ניתוח Hi-C מבחן HKA חיפוש פרופילים ב-HMMER מידול הומולוגי מיפוי IBD ניתוח גושי אי-שוויון תִּקְשׁוּר (LD)קריאת שיאים (peak calling) בסיוע למידת מכונה לנתוני ChIP-seq ניתוח שונות במספר העותקים בסיוע למידת מכונה מחקר אסוציאציות אפי-גנומי רחב-היקף בסיוע למידת מכונה (ML-EWAS)ניתוח eQTL בסיוע למידת מכונה ניתוח העשרת קבוצות גנים בסיוע למידת מכונה GWAS בסיוע למידת מכונה ניתוח מטבולומיקס בסיוע למידת מכונה ניתוח שונות מיקרוביום בסיוע למידת מכונה ניתוח העשרת מסלולים בסיוע למידת מכונה ניתוח פילוגנטי בסיוע למידת מכונה ניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסיוע למידת מכונה יישור רצפים בסיוע למידת מכונה ניתוח RNA-seq של תאים בודדים בסיוע למידת מכונה קריאת וריאנטים בסיוע למידת מכונה מבחן מקדונלד-קרייטמן ניתוח מטבולומיקה בינינג מטא-גנומי עגינה מולקולרית Multi-omics epigenome-wide association study ניתוח eQTL רב-אומי ניתוח העשרת קבוצות גנים מרובות-אומיתס ניתוח מטבולומי רב-אומי (Multi-omics Metabolomics Analysis)ניתוח שונות מיקרוביום רב-אומית ניתוח העשרת מסלולים רב-אומייים ניתוח פילוגנטי רב-אומיי ניתוח פרוטאומיקה רב-אומית ניתוח ביטוי דיפרנציאלי בריצוף RNA רב-אומיי Multi-omics single-cell RNA-seq analysis ניתוח שונות במספר עותקים מבוסס-רשת חקר אסוציאציות אפיגנטי-רחב-רשת (Network EWAS)ניתוח eQTL מבוסס רשת GWAS מבוסס-רשת ניתוח מטבולומי מבוסס-רשת ניתוח גיוון מיקרוביום מבוסס-רשת ניתוח העשרת מסלולים מבוסס-רשת ניתוח פילוגנטי מבוסס-רשת ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מבוסס-רשת של נתוני RNA-seq ניתוח RNA-seq חד-תאי מבוסס רשת קריאת וריאנטים מבוססת-רשת ניתוח העשרת מסלולים מידול פרמקופור ניתוח פילוגנטי ניגודים פילוגנטיים בלתי תלויים ציון סיכון פוליגני טופולוגיית רשת PPI ניתוח פרוטאומי QSAR מיפוי QTL מהירות RNA (RNA Velocity)ניתוח ביטוי דיפרנציאלי ב-RNA-seq סלקציה סוחפת (D של טאג'ימה)יישור רצפים קריאת שיאים ב-ChIP-seq של תא בודד ניתוח שונות מספר העתקים בתא בודד מחקר אסוציאציות אפיגנומי-רחב-תאי-יחיד (scEWAS)ניתוח eQTL של תאים בודדים ניתוח העשרת קבוצות גנים לתאים בודדים ניתוח GWAS של תא בודד ניתוח מטבולומי של תאים בודדים ניתוח גיוון מיקרוביום בתא בודד ניתוח פילוגנטי של תאים בודדים ניתוח RNA-seq של תא בודד ניתוח ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq של תא בודד מיפוי רצפי תא בודד קריאת וריאנטים ברזולוציית תא בודד קריאת שיאים בסדרת-זמן של ChIP-seq ניתוח שונות מספר העתקים בזמן מחקר התאמה של אפיגנום-רחב בזמן (time-series Epigenome-wide Association Study ניתוח eQTL מסדרות עתיות ניתוח העשרת קבוצות גנים בסדרות עתיות ניתוח מטבולומיקה סדרתי בזמן ניתוח שונות מיקרוביום בסדרות עתיות ניתוח העשרת מסלולים בזמן-סדרה ניתוח פילוגנטי של סדרות עתיות ניתוח פרוטאומיקה של סדרות עתיות ביטוי דיפרנציאלי של RNA-seq בסדרות עתיות ניתוח רצפי זמן של RNA-seq מתא בודד קריאת וריאנטים בסדרות עתיות מבחן דיס-אקווילבריום של העברה קריאת וריאנטים

עוד ב-מדעי החיים

İstatistik 21 Karar Bilimleri 7 Ölçme & Psikometri 122 Nedensellik & Kanıt 1